序卷之一脉经序学诊例总论脉式三部分位六经所属五脏所属五脏本脉体六经本脉体五脏传变病脉六经中伤病脉五用乖违病脉脉偶名状七表病脉八里病脉九道病脉卷之二太医习业五科凡例纪用备论脏腑配天地论三因论外所因论叙中
阴阳五行阴阳阳常有余，阴常不足阳化气，阴成形阳气阳强不能密，阴气乃绝阳杀阴藏阳生阴长阳生于阴阳胜则阴病阳损及阴阳中之阳阳中之阴阴不抱阳阴平阳秘阴气阴生于阳阴胜则阳病阴损及阳阴阳阴阳乖戾阴阳互根阴阳离决
序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分
素问上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合论篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九五藏生成篇第十五藏别论篇第十一异法方宜论篇第十二移
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
叙卷之一调经总论经候卷之二血崩带下淋浊卷之三妊娠临蓐卷之四产后
序求子补母益子论妊娠产后总论产后生化汤论一论血块二论血晕产后厥症产后血崩产后类伤寒三阴症产后类伤寒三阳症产后类症产后忿怒产后伤食产后气短似喘产后妄言妄见产后类中风
序证治总纲治病须明阴阳虚实论治病必审四时用药说辨症订方必先审四诊记用药宜精审慎勿疏忽记胃为生化之源记保身可以却疾说侍疾应知论疟咳嗽记中风肿胀辨虚劳说幼科治验记胸胁腹痛肝胃气逆辨温热温疫辨
序原叙原例（次序略经更定）通行经络（补）人参高丽参黄精大枣面鹿肉羊肉鳝鱼淡菜人乳人气紫河车（和）甘草香附连翘合欢皮芜荑海桐皮乳香没药竹沥荆沥广皮枳子菠菜荠菜白豆酒灵砂百沸汤鹈鹕油蜂蜜（攻）大戟甘遂商陆
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄