卷上太阳方总论卷下阳明方总论少阳方总论太阴方总论少阴方总论厥阴方总论六经方余论
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简介序卷上卷中卷下附录
简介卷之上卷之下
药性赋第一章 寒性药第二章 热性药第三章 温性药第四章 平性药
卷一中风总括中风死候类中风总括伤风总括痉病总括痉病死证破伤风痹病总括周痹痹病生死证痹入脏腑证痿病总括痿痹辨似痿病治法香港脚总括香港脚死证卷二内伤总括内伤外感辨似虚劳总括虚劳死证虚劳治法痨瘵总括痨瘵治法
序卷一总赋寒性热性温性平性用药发明标本论用药法药性升降浮沉补泻法五脏所欲五脏所苦五气凑五脏例五行五色五味走五脏主禁例手足三阳表里引经主治例诸药泻诸经之火邪诸药相反例十八反歌十九畏歌六陈歌五脏补泻主治例
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
第1部分第2部分